Welcome, Guest. Please Login or Register
UGENE Bulletin Board
  Welcome to our forum.
  HomeHelpSearchLoginRegister  
 
 
Page Index Toggle Pages: 1
Sitecon (Read 6201 times)
Mar 23rd, 2009 at 11:34am

Kseniya   Offline
YaBB Newbies

Posts: 20
*
 
1. Возможен ли поиск сразу по всем моделям? И тогда удобнее, если найденные районы (аннотации) будут группироваться по моделям.

2. Удобнее было бы, если бы у каждой модели была ссылка сразу в базу данных или хотя бы некоторая информация о конкретной группе транскрипционных факторов.

3. Когда выбираешь модель, автоматически проставляется какая-то допустимая ошибка по умолчанию и для всех моделей разная. Это основано на чем-то научном или просто случайно?

спасибо за ответы. Huh
 
IP Logged
 
Reply #1 - Mar 23rd, 2009 at 7:48pm

Alexey Varlamov   Offline
YaBB Administrator
Novosibirsk, Russia

Gender: male
Posts: 11
*****
 
1. Такой функционал существует в дизайнере схем, прилагаю пример - нужно только задать все адреса: входную последовательность, список моделей и выходной файл Генбанк. (Правда группировать по моделям пока не получится.)
В обычный диалог поддержку многих моделей добавлять не планировали.
2. Согласен, мы уже обратились к автору алгоритма с просьбой предоставить дополнительную информацию по моделям.
3. Упрощая, сейчас это минимальная рекомендуемая ошибка для данной модели (ошибка I рода >=0.75). Предполагается, что в будущем модели будут указывать оптимальную оценку.

Спасибо за интерес к программе  Smiley
 
IP Logged
 
Page Index Toggle Pages: 1