При обновлении из репозитория программа обновляется, но с ошибками:

Code:

Текущее состояние: 4 обновлено [+3], 68794 новых [+4]. Следующие пакеты будут обновлены:                  ugene ugene-data ugene-non-free 3 пакетов обновлено, 0 установлено новых, 0 пакетов отмечено для удаления, и 1 пакетов не обновлено. Необходимо получить 23,1 MБ архивов. После распаковки 4 996 kБ будет занято. Хотите продолжить? [Y/n/?] Получено: 1 http://ppa.launchpad.net/iefremov/ppa/ubuntu/ trusty/main ugene-data all 1.14.0+repack-0ubuntu1~trusty [6 431 kB] Получено: 2 http://ppa.launchpad.net/iefremov/ppa/ubuntu/ trusty/main ugene amd64 1.14.0+repack-0ubuntu1~trusty [16,1 MB] Получено: 3 http://ppa.launchpad.net/iefremov/ppa/ubuntu/ trusty/main ugene-non-free amd64 1.14.0+repack-0ubuntu1~trusty [523 kB] Получено 23,1 MБ в 1мин 4с (359 kБ/с)                                           (Чтение базы данных … на данный момент установлено 453927 файлов и каталогов.) Подготовка к распаковке …/ugene-data_1.14.0+repack-0ubuntu1~trusty_all.deb … Распаковывается ugene-data (1.14.0+repack-0ubuntu1~trusty) на замену (1.13.3+repack-2ubuntu1~trusty) … Подготовка к распаковке …/ugene_1.14.0+repack-0ubuntu1~trusty_amd64.deb … Распаковывается ugene (1.14.0+repack-0ubuntu1~trusty) на замену (1.13.3+repack-2ubuntu1~trusty) … Подготовка к распаковке …/ugene-non-free_1.14.0+repack-0ubuntu1~trusty_amd64.deb … Распаковывается ugene-non-free (1.14.0+repack-0ubuntu1~trusty) на замену (1.13.3+repack-2ubuntu1~trusty) … dpkg: ошибка при обработке архива /var/cache/apt/archives/ugene-non-free_1.14.0+repack-0ubuntu1~trusty_amd64.deb (--unpack): попытка перезаписать «/usr/lib/ugene/plugins/snp_effect.license», который уже имеется в пакете ugene 1.14.0+repack-0ubuntu1~trusty Обрабатываются триггеры для man-db (2.6.7.1-1) … Обрабатываются триггеры для bamfdaemon (0.5.1+14.04.20140409-0ubuntu1) … Rebuilding /usr/share/applications/bamf-2.index... Обрабатываются триггеры для desktop-file-utils (0.22-1ubuntu1) … Обрабатываются триггеры для mime-support (3.54ubuntu1) … Обрабатываются триггеры для gnome-menus (3.10.1-0ubuntu2) … При обработке следующих пакетов произошли ошибки: /var/cache/apt/archives/ugene-non-free_1.14.0+repack-0ubuntu1~trusty_amd64.deb E: Sub-process /usr/bin/dpkg returned an error code (1) Не удалось установить пакет.  Попытка восстановить: Настраивается пакет ugene-data (1.14.0+repack-0ubuntu1~trusty) … Настраивается пакет ugene (1.14.0+repack-0ubuntu1~trusty) …                                                  Текущее состояние: 2 обновлено [-2].

Сама программа запускается и работает, но в проекте, созданном под 1.13.3, почему-то исчезли почти все файлы...

В версии 1.14 Project View сильно изменился изнутри. Мы проверили обратную совместимость со старыми проектами, созданными в 1.13.3, но возможно за чем-то не уследили. Вы не могли бы прислать проект, который не открывается, желательно с данными (если, конечно, они не секретные)?

Он открывается, но из большого числа файлов в нем видно только очень немного... С данными сложно, потому что я точно не помню, что в нем было :) И я его уже пересохранил в 1.14, не знаю, важно ли это.

---

Илья, так это уже пересохраненный проект? У нас локально он открывается и в 1.13.3 и в 1.14 с одинаковым набором данных.

Да, пересохраненный только, к сожалению. У вас открывается и в нем всего 4-5 файлов?

Всего 6 документов. И в самом текстовом файле проекта столько же.

Да, понятно, спасибо. В общем, не удастся разобраться, боюсь, потому что только такой перезаписанный файл есть...

Чтобы не создавать новую тему... Перестали работать Ctrl+C и Ctrl+Shift+C! А Ctrl+T и Ctrl+Shift+T работают. Копирование через контекстное меню работает.

У нас ошибка не воспроизводится. Проверили на разных версиях юджин, в частности, на 1.14, установленной из репозитория.

Даже не знаю, что еще могу сказать... У меня не работает, что очень неудобно :(

Ilya Flyamer wrote on Aug 6^th, 2014 at 3:23pm:

Даже не знаю, что еще могу сказать... У меня не работает, что очень неудобно :(

Илья,
можно запустить Ugene из консоли:
ugene -ui

И попробовать нажать не работающие комбинации клавиш. Есть вероятность, что в консоль будут выводиться отладочные сообщения Qt. Вот если они выводятся, то можно их прислать нам. Думаю это должно как-то прояснить ситуацию.

Нет, ничего не выводится :(

Так а в других программах горячие клавиши работают?
Пробовали "выключить и включить компьютер"?..  :)

Да, на оба вопроса :)

Не знаю, как Вам помочь. Не уверена, но может ошибки проявились из-за того, что не сразу установилось. Попробуйте другой пакет юджин скачать и в нем проверьте. Возможно эту версию придется переустановить (?).

Да, тупая переустановка (удалил apt-get remove и поставил apt-get install) помогла! Спасибо :)

Отлично, рада, что все заработало :)

Прошу прощения, я что-то поторопился... Опять не работает :(

Почему подумали, что работает? Попробуйте, пожалуйста, еще универсальный линуксовый пакет юджин скачать?

Подумал что работает, потому что удалось скопировать что-то :)
Да, хорошая мысль, сейчас попробую.

В нем работает.

Попробуйте еще, пожалуйста, удалить .ini файл?
Это можно сделать:
1) Отметив "Reset settings to default on the next run" в общих настройках.
2) Или вручную удалив файл "~/.config/UGENE.ini". Можете на всякий сохранить этот файл где-нибудь, если не хотите эти настройки совсем потерять.

Помогает.

Понятно. Можете прислать нам .ini-файл, если сохранили его, попробуем поразбираться, в чем ошибка была.

Вот он :)

---

Спасибо!

Илья,
у нас получилось повторить подобную проблему с горячими клавишами. У нас она проявляется когда включена русская раскладка клавиатуры при использовании Ugene. Будем разбираться с этой проблеммой.

У меня она проявляется вне зависимости от раскладки, я пробовал и в русской, и в английской.
Спасибо!