Welcome, Guest. Please Login or Register
UGENE Bulletin Board
  Welcome to our forum.
  HomeHelpSearchLoginRegister  
 
 
Page Index Toggle Pages: 1
Некоторые предложения. (Read 6807 times)
Jan 10th, 2013 at 5:02pm

karabanow   Offline
YaBB Newbies

Posts: 7
*
 
Здравствуйте, Уважаемые создатели UGENE. Большое спасибо за Вашу программу! Функционал и интерфейс UGENE, по-моему, гораздо лучше, чем у многих западных коммерческих продуктов. Понимаю, что грешно требовать от бесплатной программы "всего и сразу", но может быть Вы учтёте и мои пожелания для дальнейшего развития программы:
1. Нельзя ли при обработке хроматограмм сделать "отключение" каналов (например, убрать сигнал от А или С), как это сделано в ABI Sequence Scanner ?
2. Нельзя ли добавить в UGENE блок построения сетей гаплотипов (NETWORK)?
Ещё раз большое Спасибо за Ваш замечательный продукт!
С Уважением
Дмитрий Карабанов
ИБВВ РАН
 
IP Logged
 
Reply #1 - Jan 14th, 2013 at 8:25pm

Konstantin Okonechnikov   Offline
Global Moderator

Posts: 173
*****
 
Здравствуйте Дмиртий!
Спасибо большое за добрые слова, мы всегда рады как положительным отызвам, так и конструктивной критике, особенно от отечественных пользователей Smiley

Касательно Ваших вопросов

Quote:
1. Нельзя ли при обработке хроматограмм сделать "отключение" каналов (например, убрать сигнал от А или С), как это сделано в ABI Sequence Scanner ?

Это хорошее улучшение, запланировано на релиз следующей версии:
https://ugene.unipro.ru/tracker/browse/UGENE-1388

Quote:
2. Нельзя ли добавить в UGENE блок построения сетей гаплотипов (NETWORK)?

На данный момент построение сетей гаплотипов не находится в списке приоритетных направлений развития проекта. Вы можете помочь, если порекоммендуете существующие программы, желательно с открытым кодом (open-source), которые уже решают эту задачу.

C уважением,
Константин Оконечников, UGENE team
 
IP Logged
 
Reply #2 - Feb 4th, 2013 at 6:00pm

karabanow   Offline
YaBB Newbies

Posts: 7
*
 
Константин, большое Спасибо!
1. Удобно, что теперь и хроматограммы можно будет обрабатывать в uGene.
2. Медианные сети гаплотипов, как правило, строят в Network'e ( Fluxus Technology Ltd) (К сожалению, ссылки не могу вставить в сообщение). Но она, по-моему, не с открытым кодом. На GNU распространяется не очень популярная программа "Мурка". Правда, о "дружественном интерфейсе" в данном случае говорить не приходится Sad
Ещё раз огромное Спасибо всем разработчикам uGene!
 
IP Logged
 
Reply #3 - May 19th, 2013 at 9:29pm

Konstantin Okonechnikov   Offline
Global Moderator

Posts: 173
*****
 
Отключение/включение каналов хромотограм добавлено в версии 1.12 (релиз запланирован в мае).
Каналы можно переключать используя контекстное меню как на скриншоте
 

change_traces.png (114 KB | )
change_traces.png
IP Logged
 
Reply #4 - Jul 18th, 2013 at 3:02pm

karabanow   Offline
YaBB Newbies

Posts: 7
*
 
Константин, огромное Спасибо Вам и всей команде uGene !
Мечты сбываются - чтоб на компьютере осталась одна программа для всех задач Smiley
 
IP Logged
 
Page Index Toggle Pages: 1