Welcome, Guest. Please Login or Register
UGENE Bulletin Board
  Welcome to our forum.
  HomeHelpSearchLoginRegister  
 
 
Page Index Toggle Pages: 1
Установка (Read 9777 times)
Jul 4th, 2009 at 8:45am

Muenchner   Offline
YaBB Newbies

Posts: 1
*
 
Помогите, пожалуйста, установить UGENE на Ubuntu 8.10. Пробовал безуспешно поставить pre-built package для 9.04. Для компиляции исходного кода моих познаний в linux недостаточно. Если нужно что-то писать в терминале, не могли бы Вы дать подробную инструкцию.
Заранее спасибо
 
IP Logged
 
Reply #1 - Jul 6th, 2009 at 2:22pm

Ivan Efremov   Offline
YaBB Administrator
Novosibirsk

Gender: male
Posts: 46
*****
 
Добрый день!
1) Опишите подробнее проблемы возникающие при установке бинарного пакета. Возможно их устранение будет простым.
- Какова версия Ubuntu: 32 или 64 битная?
- Какова версия UGENE?
- Откуда был скачан бинарный пакет, и совпадает ли его битность с битностью системы (x86 для 32 битной Ubuntu/amd64 для 64 битной)?
- Устанавливаете ли вы пакеты в правильном порядке (сперва ugene-data, затем ugene)
- Установлена ли в системе библиотека Qt и какова ее версия? Посмотреть можно в менеджере пакетов Synaptic (см. скриншот 1 qt_installed.png)
- Как именно вы устанавливаете пакет и что происходит не так.

Инструкция по сборке из исходных кодов:
0) Установить пакет libqt4-dev. Это удобно делать из менеджера пакетов synaptic (см. скриншоты 2-3 - вид до и после установки)
1) Скачать ugene-1.4.2.tar.gz http://ugene.unipro.ru/downloads/ugene-1.4.2.tar.gz
2) Распаковать архив (либо из графической оболочки, либо командой tar -xzf ugene-1.4.2.tar.gz
3) В терминале зайти в распакованную папку: cd ugene-1.4.2/
4) выполнить команду qmake -r
5) выполнить команду make
6) выполнить команду sudo make install (для этого требуются привилегии администратора)

Сборка занимает приблизительно полчаса на Пентиуме 4.
После выполнения этих шагов UGENE будет добавлен в меню приложений, а также будет доступен из консоли командой ugene

Напомню также, что на этой неделе выходит новая версия UGENE: 1.5.0.
 

UGENE team
IP Logged
 
Reply #2 - Nov 28th, 2010 at 5:33pm

Yulia   Offline
YaBB Newbies

Posts: 1
*
 
Установила UGENE через репозиторий Ubuntu (у меня Lucid Lynx), при проверке обновлений пишет "локальная версия 1.5.2 последняя версия 1.8.0" попыталась обновить версию. удаление и установка заново не помогли (был совет на этом форуме)
добавленила репозиторий ppa:iefremov/ppa
потом удалила и переустановила заново, и вообще перестал запускаться графический интерфейс ugene

yulia@yulia-desktop:~$ ugene -ui
QObject::connect: Cannot connect (null)::si_projectURLChanged(const QString&) to GB2::ProjectLoaderImpl::sl_projectURLChanged(const QString&)
QObject::connect: Cannot connect (null)::si_documentAdded(Document*) to GB2::ProjectLoaderImpl::sl_documentAdded(Document*)
QObject::connect: Cannot connect (null)::si_documentAdded(Document*) to GB2::ProjectViewImpl::sl_onDocumentAdded(Document*)
QObject::connect: Cannot connect (null)::si_documentRemoved(Document*) to GB2::ProjectViewImpl::sl_onDocumentRemoved(Document*)
QObject::connect: Cannot connect (null)::si_modifiedStateChanged() to GB2::ProjectViewImpl::sl_onProjectModifiedStateChanged()
QObject::connect: Cannot connect (null)::si_documentAdded(Document*) to GB2::ProjectTreeController::sl_onDocumentAddedToProject(Document*)
QObject::connect: Cannot connect (null)::si_documentRemoved(Document*) to GB2::ProjectTreeController::sl_onDocumentRemovedFromProject(Document*)
Segmentation fault

Что мне сделать, чтобы Ugene снова заработал?
версия теперь вроде поновее 1.7.2
 
IP Logged
 
Reply #3 - Nov 29th, 2010 at 12:08pm

Konstantin Okonechnikov   Offline
Global Moderator

Posts: 173
*****
 
Юлия,
мы постараемся воспроизвести и исправить проблему как можно скорее. Как было выполнено удаление программы? apt-get remove ugene?

Что можно попробовать сделать:
1) Удалить старый файл конфигурации:
rm -rf ~/.config/Unipro и попробовать запустить UGENE снова.
2) Скачать и установить универсальный бинарный дистрибутив Ugene для Linux: обычная и 64-битная версия.
Для уставновки нужно просто распаковать архив в подходящую папку. Затем выполнить
./ugene -ui из распакованного архива.


 
IP Logged
 
Page Index Toggle Pages: 1