UGENE Forum | |
https://forum.ugene.net/forum/YaBB.pl
General Category >> Forum in Russian language ([ch1056][ch1091][ch1089][ch1089][ch1082][ch1086][ch1103][ch1079][ch1099][ch1095][ch1085][ch1099][ch1081] [ch1092][ch1086][ch1088][ch1091][ch1084]) >> 32-битные пакеты в 64-битном билде Ugene? https://forum.ugene.net/forum/YaBB.pl?num=1442331179 Message started by Yury on Sep 15th, 2015 at 10:32pm |
Title: 32-битные пакеты в 64-битном билде Ugene? Post by Yury on Sep 15th, 2015 at 10:32pm
Доброго дня разработчикам, и вообще версии 1.18!
Скажите пожалуйста, а какой смысл в комплектации 64-битного билда Ugene 32-битными версиями утилит (в частности, сейчас речь идёт о T-coffee)? И, кроме того, однопоточными версиями? Когда я запускаю множественное выравнивание, которое выполняется заметное время, я вижу в списке задач t_coffee.orig.exe - он 32-битный, и занимает только одно ядро (из 8). Заранее спасибо |
Title: Re: 32-битные пакеты в 64-битном билде Ugene? Post by Denis Kandrov on Sep 17th, 2015 at 5:59pm
Добрый день, Юрий.
Спасибо за вопрос. Оригинальная программа не имеет Windows версии, и разработчики предлагаю своим пользователям ставить виртуальную машину и на ней запускать T-Coffee. Мы пока портировали программу только для 32-битную систему, для 64-битной и более новой версии имеется задача в баг трекере. Про многопоточность разработчики программы пишут, что она должна работать по умолчанию. Возможно при портировании на Windows мы упустили этот момент. Я создал соответствующую задачу в трекере. Хотелось бы поитересоваться, что вы выравниваете? (какое количество и длинна последовательностей) |
Title: Re: 32-битные пакеты в 64-битном билде Ugene? Post by Denis Kandrov on Oct 2nd, 2015 at 5:59pm
Юрий, ещё раз добрый день!
Я перепроверил T-Сoffee под Widows, и у меня он запускается в многопоточном режиме :-? Не могли бы вы выслать пример данных, на которых у вас повторяется однопоточное выполнение? Или описать подробнее выравнивание с которым работаете: количество последовательностей, средняя длинна последовательностей? Адрес куда можно выслать данные: ugene@unipro.ru Заранее спасибо. |
UGENE Forum » Powered by YaBB 2.5 AE! YaBB Forum Software © 2000-2010. All Rights Reserved. |