UGENE Forum
https://forum.ugene.net/forum/YaBB.pl
General Category >> Forum in Russian language ([ch1056][ch1091][ch1089][ch1089][ch1082][ch1086][ch1103][ch1079][ch1099][ch1095][ch1085][ch1099][ch1081] [ch1092][ch1086][ch1088][ch1091][ch1084]) >> Некоторые предложения.
https://forum.ugene.net/forum/YaBB.pl?num=1357812178
Message started by karabanow on Jan 10th, 2013 at 5:02pm

Title: Некоторые предложения.
Post by karabanow on Jan 10th, 2013 at 5:02pm
Здравствуйте, Уважаемые создатели UGENE. Большое спасибо за Вашу программу! Функционал и интерфейс UGENE, по-моему, гораздо лучше, чем у многих западных коммерческих продуктов. Понимаю, что грешно требовать от бесплатной программы "всего и сразу", но может быть Вы учтёте и мои пожелания для дальнейшего развития программы:
1. Нельзя ли при обработке хроматограмм сделать "отключение" каналов (например, убрать сигнал от А или С), как это сделано в ABI Sequence Scanner ?
2. Нельзя ли добавить в UGENE блок построения сетей гаплотипов (NETWORK)?
Ещё раз большое Спасибо за Ваш замечательный продукт!
С Уважением
Дмитрий Карабанов
ИБВВ РАН

Title: Re: Некоторые предложения.
Post by Konstantin Okonechnikov on Jan 14th, 2013 at 8:25pm
Здравствуйте Дмиртий!
Спасибо большое за добрые слова, мы всегда рады как положительным отызвам, так и конструктивной критике, особенно от отечественных пользователей :)

Касательно Ваших вопросов


Quote:
1. Нельзя ли при обработке хроматограмм сделать "отключение" каналов (например, убрать сигнал от А или С), как это сделано в ABI Sequence Scanner ?

Это хорошее улучшение, запланировано на релиз следующей версии:
https://ugene.unipro.ru/tracker/browse/UGENE-1388


Quote:
2. Нельзя ли добавить в UGENE блок построения сетей гаплотипов (NETWORK)?

На данный момент построение сетей гаплотипов не находится в списке приоритетных направлений развития проекта. Вы можете помочь, если порекоммендуете существующие программы, желательно с открытым кодом (open-source), которые уже решают эту задачу.

C уважением,
 Константин Оконечников, UGENE team

Title: Re: Некоторые предложения.
Post by karabanow on Feb 4th, 2013 at 6:00pm
Константин, большое Спасибо!
1. Удобно, что теперь и хроматограммы можно будет обрабатывать в uGene.
2. Медианные сети гаплотипов, как правило, строят в Network'e ( Fluxus Technology Ltd) (К сожалению, ссылки не могу вставить в сообщение). Но она, по-моему, не с открытым кодом. На GNU распространяется не очень популярная программа "Мурка". Правда, о "дружественном интерфейсе" в данном случае говорить не приходится :(
Ещё раз огромное Спасибо всем разработчикам uGene!

Title: Re: Некоторые предложения.
Post by Konstantin Okonechnikov on May 19th, 2013 at 9:29pm
Отключение/включение каналов хромотограм добавлено в версии 1.12 (релиз запланирован в мае).
Каналы можно переключать используя контекстное меню как на скриншоте
change_traces.png (114 KB | )

Title: Re: Некоторые предложения.
Post by karabanow on Jul 18th, 2013 at 3:02pm
Константин, огромное Спасибо Вам и всей команде uGene !
Мечты сбываются - чтоб на компьютере осталась одна программа для всех задач :)

UGENE Forum » Powered by YaBB 2.5 AE!
YaBB Forum Software © 2000-2010. All Rights Reserved.